В соответствии со ст. 26 «Управление образовательной организацией» ФЗ «Об образовании в Российской Федерации» управление Бубчиковской средней общеобразовательной школой осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации с учетом особенностей, установленных Федеральным законом.
Управление образовательной организацией осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
В Бубчиковской средней общеобразовательной школе сформированы коллегиальные органы управления, к которым относятся общее собрание работников, педагогический совет. В целях учета мнения обучающихся, родителей (законных представителей) несовершеннолетних обучающихся и педагогических работников по вопросам управления образовательной организацией действуют: совет родителей, совет учащихся, профессиональный союз — представительный орган работников, предусмотренные Положением о филиале МОУ «Верхнесинячихинская СОШ №3» — Бубчиковская СОШ.
Структура, порядок формирования, срок полномочий и компетенция органов управления в Бубчиковской средней общеобразовательной школе, порядок принятия ими решений и выступления от имени школы устанавливаются Положением о филиале МОУ «Верхнесинячихинская СОШ №3» — Бубчиковская СОШ.